Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa4P06798 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms