Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06321 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06321 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06321 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06321 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06321 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06321 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06321 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06321 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P06321 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06321 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06321 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06321 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06321 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06321 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06321 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06321 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06321 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06321 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06321 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06321 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P06321 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06321 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06321 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06321 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06321 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06321 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06321 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06321 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06321 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06321 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P06321 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06321 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06321 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06321 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06321 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06321 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P06321 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06321 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06321 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06321 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06321 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06321 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06321 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06321 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06321 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06321 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06321 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06321 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06321 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P06321 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms