Protein–RNA interactions for Protein: P01851

T-cell receptor beta-2 chain C region, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01851 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01851 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01851 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01851 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01851 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01851 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01851 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01851 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01851 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01851 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01851 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01851 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01851 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01851 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01851 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01851 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01851 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01851 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01851 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01851 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01851 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01851 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01851 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01851 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01851 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01851 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01851 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01851 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01851 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01851 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01851 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01851 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01851 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01851 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01851 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01851 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01851 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01851 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01851 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01851 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01851 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01851 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01851 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01851 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01851 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01851 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01851 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01851 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01851 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01851 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01851 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01851 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01851 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01851 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01851 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01851 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01851 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01851 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01851 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01851 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01851 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01851 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01851 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01851 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01851 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01851 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01851 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01851 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01851 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01851 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01851 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01851 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01851 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01851 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 320.9 ms