Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01679 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01679 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01679 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01679 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01679 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01679 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01679 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01679 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01679 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01679 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01679 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01679 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01679 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01679 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01679 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01679 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01679 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01679 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01679 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01679 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01679 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01679 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01679 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01679 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01679 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01679 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01679 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01679 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01679 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01679 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01679 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01679 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01679 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01679 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01679 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01679 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01679 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01679 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01679 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01679 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01679 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01679 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01679 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01679 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01679 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01679 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01679 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01679 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01679 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01679 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01679 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01679 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01679 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01679 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01679 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01679 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01679 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01679 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01679 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01679 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01679 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01679 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01679 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01679 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01679 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01679 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01679 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01679 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01679 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01679 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01679 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01679 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01679 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms