Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01641 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01641 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01641 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01641 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01641 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01641 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01641 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01641 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01641 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01641 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01641 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01641 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01641 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01641 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01641 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01641 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01641 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01641 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01641 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01641 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01641 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01641 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01641 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01641 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01641 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01641 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01641 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01641 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01641 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01641 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01641 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01641 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01641 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01641 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
P01641 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01641 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01641 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01641 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01641 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01641 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01641 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01641 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01641 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01641 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01641 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01641 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
P01641 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01641 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01641 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01641 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01641 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
P01641 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
P01641 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01641 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01641 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01641 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
P01641 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01641 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01641 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01641 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
P01641 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01641 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01641 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01641 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01641 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01641 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01641 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01641 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
P01641 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01641 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01641 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01641 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01641 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01641 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01641 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01641 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01641 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01641 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01641 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01641 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01641 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms