Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifnb1P01575 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifnb1P01575 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms