Protein–RNA interactions for Protein: P00375

Dhfr, Dihydrofolate reductase, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhfrP00375 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhfrP00375 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhfrP00375 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhfrP00375 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DhfrP00375 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DhfrP00375 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhfrP00375 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhfrP00375 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhfrP00375 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhfrP00375 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DhfrP00375 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhfrP00375 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhfrP00375 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhfrP00375 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhfrP00375 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DhfrP00375 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms