Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccl20O89093 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccl20O89093 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccl20O89093 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccl20O89093 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccl20O89093 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccl20O89093 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccl20O89093 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccl20O89093 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccl20O89093 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccl20O89093 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccl20O89093 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccl20O89093 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccl20O89093 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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