Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MscO88940 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MscO88940 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MscO88940 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MscO88940 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MscO88940 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MscO88940 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MscO88940 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MscO88940 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MscO88940 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MscO88940 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MscO88940 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MscO88940 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MscO88940 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MscO88940 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
MscO88940 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MscO88940 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MscO88940 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MscO88940 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MscO88940 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MscO88940 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MscO88940 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MscO88940 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MscO88940 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MscO88940 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MscO88940 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MscO88940 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MscO88940 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MscO88940 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MscO88940 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MscO88940 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MscO88940 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MscO88940 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MscO88940 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MscO88940 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MscO88940 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MscO88940 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MscO88940 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MscO88940 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MscO88940 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MscO88940 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MscO88940 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MscO88940 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MscO88940 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MscO88940 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MscO88940 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MscO88940 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MscO88940 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MscO88940 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MscO88940 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MscO88940 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms