Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JtbO88824 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JtbO88824 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JtbO88824 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JtbO88824 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JtbO88824 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JtbO88824 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JtbO88824 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JtbO88824 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JtbO88824 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JtbO88824 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JtbO88824 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JtbO88824 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JtbO88824 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JtbO88824 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JtbO88824 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JtbO88824 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
JtbO88824 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JtbO88824 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JtbO88824 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JtbO88824 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
JtbO88824 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JtbO88824 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JtbO88824 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JtbO88824 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
JtbO88824 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JtbO88824 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JtbO88824 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JtbO88824 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JtbO88824 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JtbO88824 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JtbO88824 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JtbO88824 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JtbO88824 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JtbO88824 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JtbO88824 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JtbO88824 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JtbO88824 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JtbO88824 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JtbO88824 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JtbO88824 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JtbO88824 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JtbO88824 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JtbO88824 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JtbO88824 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JtbO88824 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JtbO88824 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JtbO88824 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JtbO88824 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JtbO88824 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JtbO88824 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JtbO88824 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JtbO88824 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JtbO88824 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JtbO88824 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JtbO88824 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
JtbO88824 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JtbO88824 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JtbO88824 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JtbO88824 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JtbO88824 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
JtbO88824 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JtbO88824 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JtbO88824 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JtbO88824 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JtbO88824 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JtbO88824 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JtbO88824 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JtbO88824 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JtbO88824 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JtbO88824 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JtbO88824 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
JtbO88824 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JtbO88824 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JtbO88824 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
JtbO88824 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms