Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tom1O88746 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1O88746 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1O88746 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1O88746 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1O88746 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tom1O88746 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tom1O88746 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tom1O88746 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tom1O88746 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tom1O88746 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tom1O88746 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tom1O88746 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms