Protein–RNA interactions for Protein: O88665

Brd7, Bromodomain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd7O88665 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd7O88665 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd7O88665 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd7O88665 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd7O88665 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd7O88665 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms