Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3bO88509 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms