Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme6O88425 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme6O88425 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme6O88425 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme6O88425 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme6O88425 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme6O88425 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme6O88425 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms