Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cfdp1O88271 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfdp1O88271 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cfdp1O88271 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfdp1O88271 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfdp1O88271 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfdp1O88271 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms