Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd46O88174 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd46O88174 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd46O88174 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd46O88174 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd46O88174 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd46O88174 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms