Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lnx1O70263 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms