Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb2O55203 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms