Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Supt5hO55201 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt5hO55201 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms