Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx4O55187 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms