Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja1O55176 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja1O55176 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja1O55176 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja1O55176 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja1O55176 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms