Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlx3O55144 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms