Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2a2O55143 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms