Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif6O55135 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif6O55135 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif6O55135 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eif6O55135 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Eif6O55135 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Eif6O55135 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Eif6O55135 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Eif6O55135 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms