Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap2O55126 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap2O55126 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms