Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Dsg2O55111 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dsg2O55111 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms