Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms