Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnk2O54967 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnk2O54967 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnk2O54967 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms