Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf13O54965 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf13O54965 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms