Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LatO54957 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LatO54957 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LatO54957 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LatO54957 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LatO54957 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LatO54957 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LatO54957 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LatO54957 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LatO54957 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LatO54957 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LatO54957 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LatO54957 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LatO54957 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LatO54957 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LatO54957 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LatO54957 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LatO54957 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LatO54957 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LatO54957 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LatO54957 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LatO54957 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LatO54957 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LatO54957 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LatO54957 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LatO54957 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LatO54957 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LatO54957 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LatO54957 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LatO54957 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LatO54957 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LatO54957 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LatO54957 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LatO54957 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LatO54957 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LatO54957 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LatO54957 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LatO54957 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LatO54957 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LatO54957 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LatO54957 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LatO54957 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LatO54957 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LatO54957 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LatO54957 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LatO54957 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LatO54957 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LatO54957 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LatO54957 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LatO54957 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LatO54957 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LatO54957 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LatO54957 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms