Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sema6bO54951 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema6bO54951 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema6bO54951 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms