Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms