Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DffaO54786 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DffaO54786 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DffaO54786 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DffaO54786 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DffaO54786 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DffaO54786 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DffaO54786 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DffaO54786 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DffaO54786 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DffaO54786 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DffaO54786 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DffaO54786 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DffaO54786 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DffaO54786 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DffaO54786 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DffaO54786 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DffaO54786 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DffaO54786 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DffaO54786 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DffaO54786 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DffaO54786 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DffaO54786 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DffaO54786 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DffaO54786 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DffaO54786 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DffaO54786 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DffaO54786 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DffaO54786 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DffaO54786 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DffaO54786 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DffaO54786 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DffaO54786 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DffaO54786 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DffaO54786 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DffaO54786 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DffaO54786 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DffaO54786 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DffaO54786 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DffaO54786 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DffaO54786 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DffaO54786 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DffaO54786 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DffaO54786 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DffaO54786 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DffaO54786 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DffaO54786 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DffaO54786 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DffaO54786 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DffaO54786 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DffaO54786 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DffaO54786 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DffaO54786 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DffaO54786 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DffaO54786 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DffaO54786 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DffaO54786 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DffaO54786 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DffaO54786 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DffaO54786 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DffaO54786 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DffaO54786 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DffaO54786 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DffaO54786 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DffaO54786 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DffaO54786 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DffaO54786 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DffaO54786 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DffaO54786 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DffaO54786 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DffaO54786 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DffaO54786 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DffaO54786 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DffaO54786 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DffaO54786 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DffaO54786 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DffaO54786 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DffaO54786 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DffaO54786 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DffaO54786 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DffaO54786 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DffaO54786 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DffaO54786 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DffaO54786 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DffaO54786 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DffaO54786 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DffaO54786 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DffaO54786 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DffaO54786 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DffaO54786 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DffaO54786 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DffaO54786 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DffaO54786 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DffaO54786 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DffaO54786 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DffaO54786 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DffaO54786 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DffaO54786 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DffaO54786 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DffaO54786 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms