Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EdaO54693 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EdaO54693 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EdaO54693 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EdaO54693 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EdaO54693 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EdaO54693 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EdaO54693 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EdaO54693 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EdaO54693 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EdaO54693 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EdaO54693 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EdaO54693 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EdaO54693 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EdaO54693 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EdaO54693 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EdaO54693 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EdaO54693 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EdaO54693 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EdaO54693 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EdaO54693 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EdaO54693 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EdaO54693 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EdaO54693 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EdaO54693 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EdaO54693 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EdaO54693 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EdaO54693 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EdaO54693 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EdaO54693 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EdaO54693 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EdaO54693 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EdaO54693 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EdaO54693 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EdaO54693 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EdaO54693 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EdaO54693 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EdaO54693 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EdaO54693 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EdaO54693 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EdaO54693 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EdaO54693 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EdaO54693 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EdaO54693 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EdaO54693 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EdaO54693 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EdaO54693 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EdaO54693 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EdaO54693 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EdaO54693 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EdaO54693 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EdaO54693 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EdaO54693 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EdaO54693 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EdaO54693 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EdaO54693 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EdaO54693 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EdaO54693 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EdaO54693 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EdaO54693 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EdaO54693 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EdaO54693 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EdaO54693 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EdaO54693 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
EdaO54693 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EdaO54693 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EdaO54693 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EdaO54693 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EdaO54693 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EdaO54693 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EdaO54693 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms