Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FxnO35943 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FxnO35943 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FxnO35943 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FxnO35943 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FxnO35943 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FxnO35943 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FxnO35943 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FxnO35943 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FxnO35943 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FxnO35943 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FxnO35943 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FxnO35943 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FxnO35943 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FxnO35943 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FxnO35943 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FxnO35943 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FxnO35943 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FxnO35943 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FxnO35943 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FxnO35943 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FxnO35943 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FxnO35943 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FxnO35943 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FxnO35943 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FxnO35943 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FxnO35943 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FxnO35943 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FxnO35943 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FxnO35943 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FxnO35943 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FxnO35943 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FxnO35943 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FxnO35943 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FxnO35943 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FxnO35943 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FxnO35943 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FxnO35943 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FxnO35943 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FxnO35943 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FxnO35943 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FxnO35943 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FxnO35943 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FxnO35943 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FxnO35943 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FxnO35943 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FxnO35943 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FxnO35943 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FxnO35943 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FxnO35943 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FxnO35943 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FxnO35943 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FxnO35943 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FxnO35943 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FxnO35943 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FxnO35943 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FxnO35943 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FxnO35943 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FxnO35943 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FxnO35943 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FxnO35943 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FxnO35943 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FxnO35943 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FxnO35943 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FxnO35943 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FxnO35943 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FxnO35943 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FxnO35943 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FxnO35943 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FxnO35943 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FxnO35943 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FxnO35943 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FxnO35943 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FxnO35943 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FxnO35943 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FxnO35943 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FxnO35943 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FxnO35943 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FxnO35943 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FxnO35943 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FxnO35943 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FxnO35943 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FxnO35943 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FxnO35943 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FxnO35943 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FxnO35943 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FxnO35943 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FxnO35943 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FxnO35943 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FxnO35943 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FxnO35943 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FxnO35943 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FxnO35943 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FxnO35943 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FxnO35943 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FxnO35943 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FxnO35943 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FxnO35943 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FxnO35943 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FxnO35943 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms