Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gp1baO35930 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms