Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CaluO35887 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CaluO35887 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CaluO35887 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CaluO35887 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CaluO35887 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CaluO35887 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CaluO35887 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CaluO35887 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CaluO35887 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CaluO35887 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CaluO35887 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CaluO35887 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CaluO35887 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CaluO35887 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CaluO35887 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CaluO35887 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CaluO35887 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CaluO35887 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CaluO35887 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CaluO35887 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CaluO35887 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CaluO35887 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CaluO35887 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CaluO35887 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CaluO35887 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CaluO35887 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CaluO35887 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CaluO35887 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CaluO35887 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CaluO35887 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CaluO35887 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CaluO35887 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CaluO35887 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CaluO35887 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CaluO35887 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CaluO35887 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CaluO35887 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CaluO35887 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CaluO35887 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CaluO35887 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CaluO35887 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CaluO35887 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CaluO35887 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CaluO35887 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CaluO35887 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CaluO35887 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CaluO35887 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CaluO35887 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CaluO35887 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CaluO35887 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CaluO35887 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CaluO35887 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CaluO35887 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CaluO35887 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CaluO35887 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CaluO35887 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CaluO35887 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CaluO35887 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CaluO35887 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CaluO35887 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CaluO35887 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CaluO35887 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CaluO35887 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CaluO35887 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CaluO35887 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CaluO35887 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CaluO35887 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CaluO35887 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CaluO35887 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CaluO35887 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CaluO35887 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CaluO35887 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CaluO35887 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CaluO35887 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CaluO35887 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CaluO35887 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CaluO35887 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CaluO35887 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CaluO35887 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CaluO35887 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CaluO35887 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CaluO35887 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CaluO35887 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CaluO35887 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CaluO35887 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CaluO35887 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CaluO35887 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CaluO35887 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CaluO35887 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CaluO35887 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CaluO35887 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CaluO35887 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CaluO35887 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CaluO35887 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CaluO35887 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CaluO35887 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CaluO35887 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CaluO35887 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CaluO35887 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms