Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfibp2O35711 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms