Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edil3O35474 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edil3O35474 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms