Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms