Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccrl2O35457 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms