Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atf6bO35451 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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