Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms