Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-ObO35424 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms