Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dgcr6O35347 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dgcr6O35347 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dgcr6O35347 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dgcr6O35347 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dgcr6O35347 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Dgcr6O35347 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Dgcr6O35347 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dgcr6O35347 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dgcr6O35347 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dgcr6O35347 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dgcr6O35347 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dgcr6O35347 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Dgcr6O35347 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dgcr6O35347 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dgcr6O35347 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dgcr6O35347 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dgcr6O35347 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Dgcr6O35347 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Dgcr6O35347 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Dgcr6O35347 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Dgcr6O35347 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Dgcr6O35347 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Dgcr6O35347 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Dgcr6O35347 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Dgcr6O35347 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dgcr6O35347 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms