Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pkd2O35245 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms