Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad6O35182 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad6O35182 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smad6O35182 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad6O35182 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad6O35182 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad6O35182 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad6O35182 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms