Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd9O35177 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Nedd9O35177 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Nedd9O35177 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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Nedd9O35177 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Nedd9O35177 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nedd9O35177 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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