Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pitx3O35160 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pitx3O35160 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms