Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn4O35054 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms